[ Foro de Python ]
Buenos dias
Recien estoy comenzando a utilizar Biopython y estoy intentando hacer una traduccion de una secuencia de DNA. Comenzando por el hecho de no poder hacer parsing de los archivos FASTA intento pegar una secuencia en varias lineas usando el object Seq y me da este error al usar el method Trasnlate:
>>> mysec
Seq('CGTAACAAGGTTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTGATGAGACCGTGG...CGC', IUPACAmbiguousDNA())
>>> mysec.translate()
Traceback (most recent call last):
File "<stdin>", line 1, in <module>
File "C:\Python27\lib\site-packages\Bio\Seq.py", line 1105, in translate
cds, gap=gap)
File "C:\Python27\lib\site-packages\Bio\Seq.py", line 2338, in _translate_str
"Codon '{0}' is invalid".format(codon))
Bio.Data.CodonTable.TranslationError: Codon 'G
A' is invalid
Agradeceria muchisimo si alguien pudiera ayudarme
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